かなり面倒な手順ですが，iOSディバイス（iPhoneと記します）のカメラロールから写真を削除した上で，フォトストリーム上や使用しているその他のiOSディバイスとMacにもフォトストリームにひもの付いた写真を残す手順が解りました．
しかし，この方法で最終的に残る写真はオリジナルよりもファイルサイズが小さくなり，位置情報が削られていることが解りました（確認できていませんが，画質やその他の情報が落とされている可能性もあります）．
しょうがないので，フォトストリームと，iOSディバイスからは，写真が欠けても，Macにオリジナルの写真が残ればよしとします．その手順は，
- iPhoneなどiOSディバイスで写真を撮る
- iCloudでシンクロさせているすべてのMacに撮った写真が行き渡るのを確認する
- 写真を撮ったiOSディバイスのカメラロールから写真を削除する
とします．iOSディバイスから3と同時に写真が消えてなくなります．Macにはフォトストリームからひもが切れた形で写真が残ります．しかしこの写真はオリジナルの画質と付加情報をもっています．
iOSディバイスには，iTunesのシンクロ時にコピーするしかなさそうです．それでも，写真の所在がMacとは違ったかたちになります．
あるいは
あるいは，カメラロールに1000枚写真がたまるまで放置して，1000枚を越した古い写真から消せば問題ないかも．1000枚もカメラロールに貯めるなんていうだらしないことできません^^;