どうも，サーバーの不安定の原因は，USBまわりというところだけは正解のようですが，USB接続のSSDでもUSB HUBでもなさそうです．
本体を予備のRaspberry Pi 4 Model B (RPi4)にしました．違いは本来のサーバーはRAM 8GBのところ，予備機は4GBというところです．
SSDのまるまるコピーなどといった負荷をかけながら動かしていて，起動から5時間経過しましたが，今のところ正常のようです．
また8GBの方もSDカードを入れてVLCで監視カメラのモニターをさせています．USBは使わない状態です．こちらも同じく5時間安定して動いています．
ということで，RPi4のハードのUSBまわりの故障のように思います．
ちなみに，GUIなしのサーバー用途でRAMは4GBもあれば十分かと思いましたが，そうでもなくて，rsyncによるディスクのまるまるコピーのようなバッファを多く使うタスクを実行していると，kswapd0が大汗をかく場面が多く，その場合zramといえどもhttpdのレスポンスはかなり悪くなります．
RPi4 8GBとなるとRPi5に価格が近くなるので迷います．