だんねん残念ながら，あきらめて，backupから，元に戻しました．
最大のネックは，GNOMEが，buildの環境をlibtoolからmeson (ninja)に変更したことです（当社調べ）．たとえばglibだと2.59.xと2.60.xの間でその変更があります．マイナーバージョンが1つ上がってこんなに変えて良いのかとわめきたくなります．GTK+3にも同様に境界があり，最新のソフトは，meson対応のGTK+やglibを要求し，逆に旧式のソフトは，libtool時代の.la拡張子のlibtool archiveを要求します．
で，記憶違いかも知れませんが，qemuは，依然としてlibtool archiveを要求するのに対し，virt-managerはmeson対応のGTK+を要求します．
まあ，ちゃんとメモを残したわけではないですが，そんな感じだったと思います．もうしばらく待って，世の中のdistroが，meson & ninja対応のGNOMEパッケージを使用するようなり，そういうのにupgradeしてから挑戦し直します．
それにつけても，ninjaって名前はなんとかなりませんかね．ネット検索しても「忍者」の情報ばかりかかります．スペイン語圏の人たちはninjaを「ニンハ」って読むんでしょうか．
ネット検索すると，どうもそのようです．