いろいろいじっていて，これができればいいという，問題点1つに絞れました．
標記の通りなんですが，iOS機器で撮影した写真を，フォトストリームから消さずにそのiOS機器のカメラロールから消すことができれば，解決です．
現状ではできません．
しょうがないのでしばらくは，カメラロールから消さないで耐えるか，あるいは，
- iOS機器(iPhoneなど)で写真を撮る
- Macの”写真”の”写真”にその写真が来たのを確認して，1台のMacで，その写真をデスクトップなどにコピー
- 1のiOS機器から，当該の写真を消す
- 全部のMacと全部のiOS機器から当該の写真が消える
- 3のMacで，デスクトップに保存しておいた写真を”写真”のドラッグアンドドロップ
- 念のため，全Mac, 全iOS機器でその写真が表示された確認
だめです．この方法だと，iOS機器は良いんですが，Macでは，最初に読み込まれて，フォトストリームとはひもが切れた写真と，フォトストリームにひも付けされた写真がダブります．ダブった写真を消して回らないといけません．
それをするんですかね^^; 全Macっていったって，たかだか，5台ですから^^;;
なんとかしてくれ，Apple!
解決策
Appleが解決策を用意してくれるまで^^;
ひもが切れた方を消さないと，またフォトストリームから写真が削除されてややこしいことになります．